Sho Fukamachi est un jeune étudiant. Il vit une vie à peu prés normale, a des amis et est heureux ainsi.

Cependant, cela ne va pas durer (ou serait-l’intérêt sinon ?). Un beau jour alors qu'il se promène sur les bords d'un lac avec son amis Tetsuro une explosion retentit au loin.
Un objet de forme assez ronde et métallique atterris auprès de nos de compères. Par curiosité, Tetsuro se saisit de l'objet afin de l'examiner.
Cet objet ne ressemble a rien que Tetsuro n'ai déjà vu. Sho suggère alors de laisser cette objet ici et de s'en aller. Tetsuro, n'en faisant qu'a sa tête et voulant emporter l'objet, force Sho à lui arracher des mains.
Il l'active accidentellement.
Par peur, Tetsuro essaye de se débarrasser de l'objet de l'envoi sur Sho qui s'en saisit. L'objet se met a briller d'une lumière bleu en son centre.

Puis l'objet s'active. Des sortes de tentacules en sortent et saisissent Sho pour finir par le recouvrir entièrement.

l'objet en question s’avérait être une Unit-g, un objet extra-terrestre dont la fonction était encore inconnue. Cet objet à pour effet de revêtir son porteur d'une armure biologique appelée Guyver.
Outre être une simple armure, cet objet se révèle comme une véritable arme, possédant des lasers, lames à haute fréquences etc...

Sho se retrouve donc transformé en Guyver. S'en suit une bataille avec un Zoanoids, une espèce de monstre hideux apparaissant suite à la transformation d'un humain.

Sho va apprendre qu'une organisation secrète nommé Chronos est à sa recherche afin de récupérer l'unit-g.

Quel est le but de Chronos, et surtout qui se cache derrière ? Que sont vraiment les Zoanoïds ? Existe-il d'autres Guyver ? Comment Sho peut-il s'en sortir ?